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Ponente
Wilfredo Valdivieso Quintero
Equipo de trabajo
Jose Luis Ropero Vega
María Jesús Lobo Castañón
Noemi de los Santos Álvarez
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Ponente
RESUMEN:
Los aptameros son cadenas de nucleótidos (naturales o artificiales), de una sola hebra, que pueden plegarse sobre si mismas y adquirir diferentes conformaciones. Estas estructuras pueden interactuar de forma específica con su ligando y por esto se han utilizado como elementos de reconocimiento para el desarrollo de pruebas diagnósticas. Existen diferentes aptámeros para la detección del antígeno específico de próstata (PSA) obtenidos por medio de la técnica SELEX, los cuales presentan diferentes capacidades de unión a su blanco. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la capacidad de unión de diferentes aptameros publicados frente a nuevas versiones obtenidas mediante estudios bioinformáticos. Para esto se revisaron secuencias reportadas desde el año 2010 hasta el 2021 para luego ser categorizadas según su constante de disociación (K d ), contenido de G/C, longitud, auto complementariedad y modelamiento de la estructura tridimensional. Se priorizaron 3 aptámeros y a partir de sus secuencias se realizaron modificaciones encaminadas a mejorar su estabilidad y capacidad de unión al PSA. Las evaluaciones se realizaron sobre electrodos serigrafiados de carbono modificados con partículas de oro sobre las cuales se inmovilizó covalentemente el PSA comercial. Los resultados obtenidos muestran al aptámero PSap4#5 como uno de los que ofrece mayor respuesta de unión al PSA.
Palabras clave: PSA; aptámeros; bioinformática.
Los aptameros son cadenas de nucleótidos (naturales o artificiales), de una sola hebra, que pueden plegarse sobre si mismas y adquirir diferentes conformaciones. Estas estructuras pueden interactuar de forma específica con su ligando y por esto se han utilizado como elementos de reconocimiento para el desarrollo de pruebas diagnósticas. Existen diferentes aptámeros para la detección del antígeno específico de próstata (PSA) obtenidos por medio de la técnica SELEX, los cuales presentan diferentes capacidades de unión a su blanco. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la capacidad de unión de diferentes aptameros publicados frente a nuevas versiones obtenidas mediante estudios bioinformáticos. Para esto se revisaron secuencias reportadas desde el año 2010 hasta el 2021 para luego ser categorizadas según su constante de disociación (K d ), contenido de G/C, longitud, auto complementariedad y modelamiento de la estructura tridimensional. Se priorizaron 3 aptámeros y a partir de sus secuencias se realizaron modificaciones encaminadas a mejorar su estabilidad y capacidad de unión al PSA. Las evaluaciones se realizaron sobre electrodos serigrafiados de carbono modificados con partículas de oro sobre las cuales se inmovilizó covalentemente el PSA comercial. Los resultados obtenidos muestran al aptámero PSap4#5 como uno de los que ofrece mayor respuesta de unión al PSA.
Palabras clave: PSA; aptámeros; bioinformática.
- Correo electrónico:w.valdivieso@udes.edu.co